在Debian上设置MongoDB的自动备份可以通过编写一个简单的shell脚本来实现，并使用cron作业定期运行该脚本。以下是一个详细的步骤指南：

1. 安装MongoDB工具

首先，确保你已经安装了MongoDB的工具包。如果没有安装，可以使用以下命令进行安装：

sudo apt-get update
sudo apt-get install -y mongodb-clients

2. 创建备份脚本

创建一个shell脚本来执行MongoDB的备份操作。你可以将这个脚本保存为/usr/local/bin/mongodb_backup.sh。

#!/bin/bash

# 设置备份目录
BACKUP_DIR="/var/backups/mongodb"
# 设置日期格式
DATE=$(date +%Y%m%d%H%M%S)
# 设置MongoDB连接信息
MONGO_HOST="localhost"
MONGO_PORT="27017"
MONGO_USER="your_username"
MONGO_PASSWORD="your_password"
MONGO_DB="your_database"

# 创建备份目录（如果不存在）
mkdir -p $BACKUP_DIR

# 执行备份
mongodump --host $MONGO_HOST --port $MONGO_PORT --username $MONGO_USER --password $MONGO_PASSWORD --authenticationDatabase admin --db $MONGO_DB --out $BACKUP_DIR/$DATE

# 压缩备份文件
tar -czvf $BACKUP_DIR/$DATE.tar.gz -C $BACKUP_DIR $DATE

# 删除原始备份目录
rm -rf $BACKUP_DIR/$DATE

echo "Backup completed successfully at $DATE"

确保脚本具有执行权限：

sudo chmod +x /usr/local/bin/mongodb_backup.sh

3. 设置cron作业

使用cron作业来定期运行备份脚本。编辑当前用户的crontab文件：

crontab -e

添加以下行来设置每天凌晨2点运行备份脚本：

0 2 * * * /usr/local/bin/mongodb_backup.sh >> /var/log/mongodb_backup.log 2>&1

保存并退出编辑器。

4. 验证备份

你可以手动运行备份脚本来验证其是否正常工作：

sudo /usr/local/bin/mongodb_backup.sh

检查日志文件/var/log/mongodb_backup.log以确保备份成功。

5. 监控和报警

为了确保备份的可靠性，你可以设置监控和报警机制。例如，你可以使用mailx或sendmail来发送备份成功的通知。

在脚本中添加邮件发送功能：

#!/bin/bash

# 设置备份目录
BACKUP_DIR="/var/backups/mongodb"
# 设置日期格式
DATE=$(date +%Y%m%d%H%M%S)
# 设置MongoDB连接信息
MONGO_HOST="localhost"
MONGO_PORT="27017"
MONGO_USER="your_username"
MONGO_PASSWORD="your_password"
MONGO_DB="your_database"
# 设置邮件接收地址
EMAIL_RECIPIENT="your_email@example.com"

# 创建备份目录（如果不存在）
mkdir -p $BACKUP_DIR

# 执行备份
mongodump --host $MONGO_HOST --port $MONGO_PORT --username $MONGO_USER --password $MONGO_PASSWORD --authenticationDatabase admin --db $MONGO_DB --out $BACKUP_DIR/$DATE

# 压缩备份文件
tar -czvf $BACKUP_DIR/$DATE.tar.gz -C $BACKUP_DIR $DATE

# 删除原始备份目录
rm -rf $BACKUP_DIR/$DATE

# 发送邮件通知
echo "Backup completed successfully at $DATE" | mailx -s "MongoDB Backup Notification" $EMAIL_RECIPIENT

echo "Backup completed successfully at $DATE"

确保你已经配置了邮件发送服务（如mailx或sendmail），并且可以发送邮件。

通过以上步骤，你就可以在Debian上设置MongoDB的自动备份，并确保备份的可靠性和及时性。