在Linux上为Node.js实现安全防护可以采取以下措施：

1. 使用Helmet中间件：Helmet是一个能够帮助增强Node.js之Express/Connect等Javascript Web应用安全的中间件。使用Helmet能帮助你的应用避免对Web攻击有XSS跨站脚本，脚本注入clickjacking以及各种非安全的请求等对Node.js的Web应用构成各种威胁。

2. 验证和清理用户输入：用户输入是恶意攻击最常见的入口点之一。验证和清理用户输入对于防止XSS(跨站脚本)、SQL注入和命令注入攻击至关重要。使用DOMPurify、express-validator和XSS-filters等库来自动化验证过程。

3. 实施强身份验证和授权：强大的身份验证策略对于保护您的应用程序免受未经授权的访问至关重要。使用bcrypt或scrypt等安全密码哈希算法，而不是Node.js内置加密库。实施多重身份验证(MFA)和单点登录(SSO)以添加额外的安全层。

4. 保持依赖关系更新和安全：如果管理不当，依赖关系可能会带来严重的漏洞。使用npm Audit和npm outdated等工具定期检查和更新依赖项。在package.json中指定固定版本以最大程度地减少意外更改，并使用锁定文件将每个依赖项(直接和传递)固定到特定的不可变版本。

5. 使用HTTPS：通过将HTTP升级为HTTPS，可以保护数据传输过程中的安全性。

6. 设置日志记录和监控：日志记录和监控对于及时识别和响应安全事件至关重要。使用Bunyan和Toobusy-js等模块实现日志记录。这有助于深入了解应用程序的活动并及早检测潜在的安全问题。

7. 避免暴露过多的错误信息：错误处理对于安全性至关重要。避免向用户返回详细的错误消息，因为它们可能会泄露敏感信息，例如路径、库版本或机密。使用catch子句包裹路由，以防止应用程序因恶意请求而崩溃，并返回通用错误消息而不是详细错误消息。

8. 使用非Root权限运行Node.js：如果您的应用程序受到威胁，以root权限运行Node.js可能会造成灾难性的后果。创建一个具有运行应用程序所需的最低权限的专用用户。这限制了安全漏洞时的潜在损害，因为攻击者只能访问专用用户的权限。

9. 定期更新Node.js版本：保持Node.js版本更新，以便及时修复已知的安全漏洞。

10. 安全编码实践：避免使用eval()函数，因为它可能会执行恶意代码。限制全局变量的使用，避免使用不安全的第三方库，定期检查和更新第三方库。

11. 输入验证与过滤：对所有用户输入进行严格的验证与过滤，防止SQL注入、XSS等攻击。可以使用express-validator和dompurify等库。

12. 使用安全工具：使用诸如Snyk、npm audit等安全工具来检测依赖项中的已知漏洞。

13. 配置Web服务器：正确配置Web服务器，例如Express，以提供适当的安全特性，如CSRF保护、CORS策略等。

14. 使用防火墙和入侵检测系统：部署防火墙和入侵检测系统来监控和阻止恶意流量。

15. 定期备份数据：定期备份数据以防止数据丢失或被篡改。

通过实施这些措施，可以显著提高基于Linux的Node.js应用程序的安全性，保护用户数据和系统的完整性。