在CentOS上设置PhpStorm自动保存，可按以下步骤操作：

1. 打开PhpStorm。
2. 选择“File”（文件）>“Settings”（设置），也可用快捷键Ctrl+Alt+S。
3. 在设置对话框左侧导航栏中，展开“Appearance & Behavior”（外观和行为），点击“System Settings”（系统设置）。
4. 在右侧“System Settings”面板中，找到“Synchronization”（同步）部分。
5. 勾选“Save files automatically if application is idle for ___ sec”（如果应用程序在___秒内没有活动，则自动保存文件），并在输入框中输入时间间隔。
6. （可选）勾选“Use ‘safe write’ (save changes to a temporary file first)”（使用“安全写入”，先将更改保存到临时文件），避免数据丢失。
7. 点击“OK”按钮保存设置。