在Ubuntu上编译Java桌面应用程序，你需要遵循以下步骤：

1. 安装Java开发工具包（JDK）： 打开终端，然后输入以下命令来安装OpenJDK（一个开源的Java实现）：

   sudo apt update
   sudo apt install openjdk-11-jdk
   

   安装完成后，你可以通过运行java -version和javac -version来检查Java和Javac（Java编译器）是否已成功安装。

2. 创建Java项目： 在你的工作目录中创建一个新的文件夹来存放Java源代码文件。例如：

   mkdir MyJavaDesktopApp
   cd MyJavaDesktopApp
   

3. 编写Java代码： 使用文本编辑器或集成开发环境（IDE）如Eclipse、IntelliJ IDEA或NetBeans编写Java代码。创建一个名为Main.java的文件，并编写你的主类和程序逻辑。

4. 编译Java代码： 在终端中，使用javac命令编译你的Java源代码文件。例如：

   javac Main.java
   

   这将生成一个名为Main.class的字节码文件。

5. 运行Java应用程序： 使用java命令运行编译后的字节码文件。例如：

   java Main
   

6. 打包Java桌面应用程序： 为了创建一个可执行的JAR文件，你需要创建一个MANIFEST.MF文件，其中包含主类的信息。在你的项目目录中创建一个名为META-INF的文件夹，并在其中创建一个名为MANIFEST.MF的文件。在该文件中添加以下内容：

   Manifest-Version: 1.0
   Main-Class: Main
   

   确保在Main-Class行后添加一个换行符。

   接下来，使用jar命令将你的项目打包成一个JAR文件。例如：

   jar cfm MyJavaDesktopApp.jar META-INF/MANIFEST.MF Main.class
   

   这将创建一个名为MyJavaDesktopApp.jar的可执行JAR文件。

7. 运行打包后的Java应用程序： 使用java -jar命令运行打包后的JAR文件。例如：

   java -jar MyJavaDesktopApp.jar
   

现在你已经成功地在Ubuntu上编译了一个Java桌面应用程序，并将其打包成一个可执行的JAR文件。你可以将这个JAR文件分发给其他用户，他们可以在安装了Java运行时的计算机上运行它。