当MongoDB在CentOS上运行缓慢时，可以通过以下步骤进行排查和优化：

硬件和配置调整

1. 增加内存：确保服务器有足够的内存来缓存数据和索引，以提高查询性能。
2. 使用SSD：用SSD替代传统硬盘以提升数据读写速度。
3. 调整操作系统设置：关闭不必要的服务，减少系统负载，例如关闭防火墙和禁用SELinux。
4. 优化内核参数：调整Max processes或files，关闭透明大页功能，修改磁盘调度算法等。

MongoDB软件配置优化

1. 调整WiredTiger缓存大小：通过 storage.wiredTiger.engineConfig.cacheSizeGB选项配置WiredTiger引擎使用内存的上限，建议根据实际内存情况调整。
2. 分配足够的oplog空间：设置合理的oplog大小，默认设置为可用disk空间的5%，但根据数据量调整。
3. 启用Log Rotation：配置日志切换，防止日志文件无限增大，占用过多磁盘空间。
4. 连接内存优化：调整每个连接数占用的内存，通过修改操作系统配置文件实现。
5. 关闭Transparent Huge Pages：禁用THP以减少内存管理开销，通过修改系统配置文件实现。

索引优化

1. 创建合适的索引：为经常用于查询的字段创建索引，如 db.collection.createIndex({ field: 1 })。
2. 覆盖索引：确保查询的字段都包含在索引中，以便实现覆盖查询，避免额外的磁盘I/O。
3. 定期审查和优化索引：使用 db.collection.getIndexes()查看集合中的所有索引，删除不再使用或重复的索引。

查询优化

1. 精简查询逻辑：使用投影限制返回字段，仅查询所需字段，减少数据传输量。
2. 优化聚合管道：复杂聚合操作可通过 match前置过滤数据，减少中间结果集大小。
3. 避免全表扫描：通过 explain("executionStats")分析执行计划，消除无索引的查询。

监控和维护

1. 使用监控工具：持续使用MongoDB的性能监控工具，如MongoDB Atlas或Ops Manager，定期监控系统性能并根据数据进行必要的调整。
2. 执行计划分析：使用 explain()和 db.currentOp()定位慢查询及锁竞争问题。

其他优化建议

1. 数据模型优化：根据应用需求选择合适的数据模型，避免过度规范化，适当的数据冗余和嵌入式文档有助于减少JOIN操作，从而优化查询性能。
2. 允许使用磁盘：为聚合操作启用磁盘使用， db.transactions.aggregate(pipeline, { allowdiskuse: true })。

通过上述优化措施，可以显著提升MongoDB在CentOS上的性能。建议结合业务场景选择优化策略，并持续监控和调整以适应数据变化和负载变化。