在Linux系统中，配置Overlay文件系统通常需要以下权限：

1. root用户权限：由于Overlay文件系统的配置涉及到系统文件和目录的修改，因此需要root用户权限来执行相关操作。可以使用sudo命令或者切换到root用户来获取所需的权限。

2. 对目标目录的写权限：在配置Overlay文件系统时，需要指定一个目标目录作为合并层（merged layer）的挂载点。因此，需要对目标目录具有写权限，以便能够创建和修改该目录下的文件和子目录。

3. 对底层文件系统的读权限：Overlay文件系统是基于两个或多个文件系统进行合并的，其中一个文件系统作为底层文件系统（lowerdir），另一个文件系统作为上层文件系统（upperdir）。因此，在配置Overlay文件系统时，需要对底层文件系统具有读权限，以便能够访问其内容。

4. 对工作目录的读写权限：Overlay文件系统还需要一个工作目录（workdir）来存储合并过程中产生的临时文件。因此，需要对工作目录具有读写权限，以便能够创建和修改其中的文件。

需要注意的是，具体的权限要求可能因不同的Linux发行版和Overlay文件系统的实现而有所不同。因此，在实际操作中，建议参考相关的文档或咨询专业人士以获取准确的权限要求。

此外，为了保证系统的安全性和稳定性，建议在进行Overlay文件系统配置之前备份相关文件和目录，并谨慎操作以避免不必要的风险。