在CentOS中进行SQL Server兼容性测试，可采用以下方法：

1. 版本兼容性检查：确认当前SQL Server版本与目标版本的兼容性，可通过SQL Server官方文档或版本发布说明验证。
2. 应用程序功能测试：升级后运行所有依赖SQL Server的应用程序，检查存储过程、视图、函数等是否正常工作。
3. 数据库完整性验证：使用DBCC CHECKDB命令检测数据库一致性，确保数据未损坏。
4. 兼容级别调整测试：若应用程序出现兼容性问题，可通过ALTER DATABASE [数据库名] SET COMPATIBILITY_LEVEL命令调整数据库兼容级别（如设置为对应SQL Server版本的级别）。
5. 性能测试：监控升级后数据库的性能指标（如查询响应时间、吞吐量等），确保满足业务需求。