在云数据库RDS环境下，MySQL数据库文件的存放位置主要依赖于操作系统和MySQL的安装方式，默认情况下，这些文件存储在特定的数据目录下，如Linux系统中通常位于/var/lib/mysql/，而在Windows系统上可能位于C:\ProgramData\MySQL\MySQL Server X.X\data，值得注意的是，具体文件的存储位置还会受到MySQL所使用的存储引擎的影响，常见的如MyISAM和InnoDB引擎会有其特定的数据和日志文件类型。
占用RDS磁盘空间的日志及文件主要包括以下几类：
1、数据库文件
.frm文件：存储数据表的结构定义，每个表对应一个同名的.frm文件。
.MYD文件：MyISAM存储引擎的表数据文件。
.MYI文件：MyISAM存储引擎的表索引文件。
ibdata1文件：InnoDB存储引擎的共享表空间文件，包含表数据和索引。
.ibd文件：InnoDB存储引擎的表数据文件（每个表一个）。
2、日志文件
undo-log和redo-log：用于数据库事务处理的日志文件。
Binlog文件：记录所有修改了数据库数据的语句的二进制日志文件，用于复制和恢复操作。
3、其他文件
错误日志文件：记录数据库运行过程中的错误信息。
临时文件：数据库操作中产生的临时数据文件。
上述文件及其管理对于维护数据库性能和稳定性至关重要，合理配置和管理日志文件可以有效地回滚事务并恢复数据，而合理的数据文件分布可以提高数据库的访问速度和效率。
相关问题与解答
Q1: 如果发现RDS磁盘空间使用率过高，应如何排查并采取措施？
A1: 检查数据文件和日志文件的大小，特别是.ibd和binlog文件是否异常增大，可以使用SQL查询来查看WAL日志的大小并进行分析，如果确认是日志文件过大，可以考虑清理不必要的日志或优化相关配置减少日志生成，如果是数据文件过大，可以分析表中的数据是否有大量过期或冗余数据，进行适当的数据清理或归档。
Q2: 如何优化MySQL的存储以减少磁盘占用？
A2: 针对InnoDB引擎，可以通过调整innodb_file_per_table参数为ON，使每个表的数据和索引存储在单独的.ibd文件中，便于管理和清理，定期对数据库进行优化操作(OPTIMIZE TABLE)，整理数据文件和索引，释放未使用的空间，还可以考虑对历史数据进行归档或删除，以减轻主数据库的压力和空间占用。