在Windows Server 2008 R2服务器上部署PHP网站后，发现访问PHP页面的响应时间明显慢于HTML页面，下面将深入探讨导致该问题的各种原因并提供针对性的解决方案：
1、PHP版本与IPv6支持
协议支持问题：默认情况下，PHP 5.3及以上版本启用了IPv6支持，当PHP尝试连接到本地MySQL数据库时，它会尝试使用IPv6协议，而如果服务器未正确配置IPv6，这可能导致连接延迟。
修改配置文件：编辑php.ini文件，并将mysql.default_socket和mysqli.default_socket参数设置为指向正确的MySQL socket地址可以缓解此问题。
禁用IPv6：如果服务器不使用IPv6，可以在php.ini文件中禁用IPv6支持，设置disable_functions = "apache_request_headers, apache_response_headers, define_syslog_variables, escapeshellarg, escapeshellcmd, eval, exec, fp, fput, ftp_connect, ftp_exec, ftp_get, ftp_login, ftp_nb_continue, ftp_nb_get, ftp_nb_put, ftp_nlist, ftp_pasv, highlight_file, mysql_pconnect, mysql_query, nl2br, nl2br_decode, ob_start, passthru, parse_ini_file, parse_ini_string, pg_connect, pg_lo_import, pg_lo_unlink, pg_lo_export, pg_lo_import, pg_query, proc_open, proc_close, proc_terminate, proc_get_status, proc_nice, proc_main, proc_terminate_resource, rand, show_source, shell_exec, system, system_exec, version_compare, xmlrpc_server_add_introspection_data, xmlrpc_server_register_method, xmlrpc_server_register_instance, xmlrpc_server_remove_introspection_data"。
2、IIS配置优化
应用程序池设置：确保为PHP应用程序分配的应用程序池有足够的内存和CPU资源，适当调整这些资源可以改善性能。
输出缓存：在IIS中启用输出缓存可以减少服务器处理每个请求的工作量，从而提高响应速度。
3、数据库优化
查询性能分析：使用诸如MySQL的EXPLAIN语句来分析查询，找出可能的性能瓶颈，并针对性地创建索引或调整查询结构。
持久连接：在PHP中使用持久数据库连接可以减少连接建立的开销，特别是在高流量的环境中。
4、代码级优化
脚本分析：利用Xdebug等工具分析PHP脚本性能，找出执行缓慢的部分并进行优化。
OPcode缓存：使用OPcache等PHP字节码缓存，可以减少解析PHP代码的时间，提高执行效率。
5、网络因素考虑
带宽检查：虽然带宽通常不是主要问题，但在高负载下，它可能成为限制因素，使用网络监控工具确保带宽未被过载。
负载均衡：在多服务器环境中实施负载均衡可以分散请求压力，保持响应时间的稳定。
解决Windows Server 2008 R2上PHP网站访问慢的问题需要从多个层面进行综合考虑和调整，通过上述措施，可以显著提高PHP网站的响应速度，提升用户体验，在实施过程中，务必注意逐步调整和测试，以确保找到最合适的解决方案。